La Unidad de Microscopía cuenta con los siguientes equipos para el análisis de diversas muestras:

• Jeol JEM 12000 MET (TEM)
• Jeol JSM 5410LV MEB (SEM)
• Olympus FV1000 Invertido Confocal in vivo(405nm, 458nm, 488nm, 514nm, 543nm, 633nm)
• Olympus FV10i Invertido Confocal (405nm, 473nm, 559nm, 635nm)
• Olympus TIRF IX81 Onda Evanescente (488nm, 443nm, 633nm)
• Nikon Biorad
• Olympus IX71 Cámara Evolution MP e Image Pro Plus (Dapi, GFP, Rodamina Cy5)
• Estereoscopio