La UUSMD fue establecida a instancia de la Coordinación de la Investigación Científica, las facultades de Química y Medicina, los Institutos de Biotecnología, Neurobiología e Investigaciones Biomédicas y del Centro de Ciencias Genómicas, todas ellas entidades académicas de la UNAM.

Ubicada en el IBt, en Cuernavaca, Morelos, la UUSMD fue creada para ofrecer servicios de secuenciación masiva de DNA o RNA, así como para realizar análisis posteriores de secuenciación genómica, resecuenciación de genomas, análisis de trasncriptomas, identificación de RNA pequeños, de patrones de metilación sobre el DNA e interacción DNA-proteína a escala genómica. Además del servivio de secuenciación, esta unidad ofrece asesoría y capacitación en el análisis de datos de secuenciación masiva de cualquier plataforma.

La unidad de secuenciación masiva está dividida en dos secciones de trabajo, una oficina y un área utilizada como bodega. El espacio total que actualmente ocupa la UUSMD es de 32 m2.