Equipo de Laboratorio

La UUSMD cuenta actualmente con un equipo de secuenciación masiva de DNA de última generación, el Genome Analyzer IIx (GAIIx) de la compañía Illumina para secuenciar bibliotecas de DNA o cDNA. Este equipo está complementado con un módulo para la generación de arreglos de DNA (cluster generation), un módulo adicional utilizado para la preparación de lecturas dobles (paired end module) y un servidor de discos con tres Terabytes (TB) de capacidad para almacenar información de manera transitoria. La unidad cuenta también con un bioanalizador de la marca Agilent Technologies (Bioanalyzer 2100) para realizar electroforesis en capilar y una campana de bioseguridad tipo II/A2 para la preparación de bibliotecas en condiciones controladas. La Unidad cuenta además con equipo menor necesario para la construcción y secuenciación de las bibliotecas como son: dos sistemas de electroforesis horizontal y uno vertical marca Biorad; un sistema de foto documentación de imágenes UVP; una microcentrífuga ventilada y otra refrigerada marca Eppendorf; minicentrífugas marca Labnet; y un concentrador de vacío marca Thermo Scientific. Cuenta también con un baño de temperatura marca Labnet; un rotador de tubos marca Labnet; un congelador a -20° C y un refrigerador a 4° C, ambos marca Sanyo, y con un horno de microondas.

Equipo de computación

Adicionalmente, la UUSMD cuenta con un clúster con 38 nodos de cálculos (164 cores en total), y tres servidores de discos con 27 TB de capacidad total en donde se almacena la información de las diferentes corridas; así como con 35 nodos de cálculo con CPUs 2 dual core AMD Opteron 2214 a 2.2 GHz con 4GB de memoria y disco Seagate de 120 GB y tres nodos de cálculo con CPUs de 2 Quad-Core AMD Opteron (tm) con procesador 2354 2.2 GHz, con 64 GB de memoria y disco duro de 500 GB. Esta infraestructura computacional, aunque pertenece a la unidad, reside en la Unidad de Cómputo del IBt.